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《南方水产科学》是由中国水产科学研究院南海水产研究所主办，国内外公开发行的学术类水产科技期刊。创刊于2005年（原名：南方水产），主要报道渔业资源、捕捞技术、渔业设施、渔业环境保护、水产养殖与增殖、渔业生物病害、水产品加工与综合利用以及水产基础研究等方面的论文、研究简报、综述等。2008年入选中国科技论文统计源期刊（中国科技核心期刊），2011年入选RCCSE中国核心学术期刊以及《中文核心期刊要目总览》2011年版，2013年入选中国科学引文数据库（CSCD），2009年以来先后被美国《化学文摘》（CA）、美国剑桥文摘（自然科学版）（CSA）、英国《动物学记录》（ZR）、英国《食品科技文摘》（FSTA）、英国《国际农业与生物科学研究中心》（CABI）、俄罗斯《文摘杂志》和波兰《哥白尼索引》（IC）、DOAJ、JST等多家国际重要检索系统收录。

《南方水产科学》立足南方，面向全国，突出学术性、地域性、实用性和可读性，重点报道国内外渔业科研、生产的新技术、新成果及新动向。