《中华胃肠外科杂志》我刊创办于1998年5月，目前是我国惟一的胃肠外科专业学术期刊。本刊的主要读者对象为普通外科和胃肠外科及相关专业临床、科研、教学的高、中级医师。办刊宗旨是：在贯彻执行理论与实践相结合、普及与提高相结合的方针，全面系统地反映国内外胃肠外科领域的学术动态，促进我国胃肠外科的学科发展和学术交流。

《中华胃肠外科杂志》设有专题述评、专题论坛、述评、专家笔谈、专题论著、论著、临床报道、病例报告、临床思维与训练、诊治指南、文献综述、医学信息等栏目；重点刊登胃肠外科及相关学科的主要研究成果和最新进展方面的文章；具有较高的学术权威性和一定的学术导向性。

《中华胃肠外科杂志》于2000年3月被吸收入国家科技部“中国科技论文统计源期刊”（中国科技核心期刊）；2005年3月又被国际上最具权威的生物医学期刊数据库——美国国立图书馆Medline数据库收录；2008年，又被北大图书馆收录为临床医学核心期刊。同时，本刊还是《中国学术期刊（光盘版）》和中国期刊网全文数据库收录期刊，是中国学术期刊综合评价数据库来源期刊；同时被收录为《中国核心期刊（遴选）数据库》，还是《中国生物医学核心期刊》；中文核心期刊(2008)。