《蚌埠医学院学报》本学报是由蚌埠医学院主办，国内外公开发行的医学综合性学术期刊。本刊采用多种形式，及时反映本院的科研成果。1995年以来学报刊载成果论文124篇，其中获安徽省科技进步一等奖7篇，二等奖8篇，三等奖10篇，另尚有一部分四等奖和省教委、省卫生厅奖。收录我校学报的国内权威数据库或文摘刊物逾16种。主要反映我院医学科研、医疗、卫生防疫等方面的新成果和新经验，促进学术交流和发展。

《蚌埠医学院学报》是中国科技论文统计源期刊（中国科技核心期刊）、中国学术期刊综合评价数据库（ChineseAcademicJournalComprehensiveEvaluationDatabase,CAJCED）统计源期刊。中国科技论文与引文数据库（ChineseScienceandTechnologyPaperandCitationDatabase，CSTPC）、中国期刊全文数据库（ChineseJournalFull-textDatabase,CJFD）、中国核心期刊（遴选）数据库、中国生物医学光盘数据库（CBMdisc）、中文生物医学期刊文献数据库（CMCC）、中文科技资料目录-医药卫生、中国生物学文献数据库、《中国生物学文摘》和中国医学文摘（十余种）等收录本学报。已进入美国化学文摘(CA)、俄罗斯文摘杂志(AJ)等国际著名检索系统。

本学报在全国高校学报中具有一定影响，曾在全国及全省学报（期刊）评比中多次获奖。1995年，获全国高等院校自然科学学报（B类）优秀学报三等奖；安徽省高等院校优秀学报二等奖；安徽省优秀科技期刊三等奖。1998年，获安徽省优秀科技期刊三等奖。1999年，获安徽省高等院校优秀学报二等奖。1999～2001年，获安徽省优秀科技期刊三等奖。2004年，获全国高校优秀科技期刊（B类）二等奖和安徽省高校优秀学报二等奖。2005年，学报荣获安徽省优秀科技期刊三等奖；学报编辑部荣获“全国高校科技期刊先进集体”称号。2009年，荣获全国高校科技期刊优秀编辑质量奖，并在安徽省高等学校学报“三优”评比中荣获优秀学报二等奖。