《同济大学学报》（社会科学版）（双月刊）创刊于1990年，是由同济大学主办的人文社会科学综合综合性学术理论刊物，双月25日出版。

《同济大学学报》（社会科学版）（双月刊）本刊是综合性学术理论刊物，以马克思列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论和“三个代表”重要理论为指导，贯彻科学发展观，贯彻党的教育方针和“百花齐放、百家争鸣”的方针，主要反映本校的两个文明建设，刊发学术文章，反映科研成果，指导教学实践，交流科教学术信息，促进科教学术的繁荣发展。获奖情况：中文核心期刊(2011)、中文核心期刊(2008)、2002年第二届全国高等学校“质量进步社科学报”、北大2008版核心期刊。

《同济大学学报（自然科学版）》（月刊）创刊于1956年，是由同济大学主办的自然科学综合性学术期刊，大16开本。

《同济大学学报（自然科学版）》主要刊登建筑、结构、桥梁、岩土、海洋、环境、生命科学、铁路、道路、机械、电子、计算机、材料、测量等工程以及数学、物理、化学、管理等学科的最新研究成果。本刊为中国自然科学核心期刊和中国科技论文统计用刊之一，并被EI等多个国际著名检索系统收录。获奖情况：国家双百期刊；第二届国家期刊奖重点科技期刊奖；1999年全国优秀高校自然科学学报一等奖；第一、第二、第三屆中國高校精品科技期刊。

《同济大学学报(医学版)》（双月刊）创刊于1980年，本刊是以基础医学与临床医学研究为主的综合性医学学术期刊，国内公开发行。中国科技论文统计源期刊，被重要数据库和文献期刊收录。主要栏目有：实验研究、调查研究、医工结合、临床研究、综述、技术方法及短篇报道等。

《同济大学学报(医学版)》以马克思列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论和“三个代表”重要理论为指导，贯彻科学发展观，贯彻党的教育方针和“百花齐放、百家争鸣”的方针，主要反映本校的两个文明建设，刊发学术文章，反映科研成果，指导教学实践，交流科教学术信息，促进科教学术的繁荣发展。

《同济大学学报(医学版)》获上海市优秀科技期刊；全国高校优秀自然科学学报及教育部优秀科技期刊三等奖；2004年全国高校优秀科技期刊评比中荣获“优秀编辑出版质量奖”、首届《中国学术期刊（光盘版）检索与评价数据规范》执行优秀奖。